Функція ферментів. Роль ферментів в організмі
Ферменти - це глобулярні білки, які допомагають протікати всім клітинним процесам. Як і всі каталізатори, вони не можуть повернути реакцію назад, а служать для її прискорення.
Локалізації ферментів у клітині
Всередині клітини індивідуальні ферменти, як правило, містяться і діють в суворо визначених органелах. Локалізація ферментів безпосередньо пов'язана з тією функцією, яку зазвичай виконує дану ділянку клітини.
Майже всі ферменти гліколізу розташовуються в цитоплазмі. Ферменти циклу трикарбонових кислот - в матриксі мітохондрій. Активні речовини гідролізу містяться в лізосомах.
Окремі тканини і органи тварин і рослин відрізняються не тільки по набору ферментів, але і за їх активності. Таку особливість тканин використовують в клініці при діагностиці деяких захворювань.
Існують також вікові особливості в активності і наборі ферментів в тканинах. Вони найбільш чітко помітні в період ембріонального розвитку при диференціювання тканин.
Номенклатура ферментів
Існує кілька систем назв, кожна з яких враховує властивості ферментів в різному ступені.
- Тривіальна. Назви речовин даються за випадковими ознаками. Наприклад, пепсин (pepsis - "травлення", грец.) І трипсин (tripsis - "розріджувати", грец.)
- Раціональна. Назва ферменту складається з субстрату і закінчення «аза». Наприклад, амілаза прискорює гідроліз крохмалю (Amylo - "крохмаль", грец.).
- Московська. Вона була прийнята в 1961 році міжнародною комісією по номенклатурі ферментів на V Міжнародному біохімічному конгресі. Назва речовини становлять з субстрату і реакції, яка каталізується (прискорюється) ферментом. Якщо функція ферментів полягає в перенесенні групи атомів від однієї молекули (субстрату) до іншої (акцептору), назва каталізатора включає в себе і хімічна назва акцептора. Наприклад, в реакції перенесення аміногрупи з аланина на 2-оксіглутаровую кислоту бере участь фермент аланин: 2-оксоглутаратамінотрансфераза. Назва відображає:
- субстрат - аланін;
- акцептор - 2-оксоглутаровая кислота;
- в реакції переноситься аминогруппа.
Міжнародною комісією був складений список всіх відомих ферментів, який постійно доповнюється. Це пов'язано з відкриттям нових речовин.
Класифікація ферментів
Ділити ферменти на групи можна двома способами. Перший пропонує два класи цих речовин:
- прості - складаються тільки з білка;
- складні - містять білкову частину (апофермент) і небілкову, звану коферментом.
У небілкову частина складного ферменту можуть входити вітаміни. Взаємодія з іншими речовинами відбувається за допомогою активного центру. Цілком молекула ферменту не приймає участі в процесі.
Властивості ферментів, як і інших білків, визначаються їх будовою. В залежності від нього каталізатори прискорюють тільки свої реакції.
Другий спосіб класифікації ділить речовини по тому, яку функцію виконують ферменти. У результаті виходить шість класів:
- оксідоредуктази;
- трансферази;
- гідролази;
- ізомерази;
- ліази;
- лігази.
Це загальноприйняті групи, відрізняються вони не тільки за видами реакцій, які регулюють складаються в них ферменти. У речовин різних груп відрізняється будова. І функції ферментів у клітині, отже, не можуть бути однаковими.
Оксидоредуктази - окислювально-відновні
функція ферментів
Основна функція ферментів першої групи - прискорення окисно-відновних реакцій. Характерна особливість: здатність утворювати ланцюга окисних ферментів, в яких здійснюється перенесення електронів або атомів водню від самого першого субстрату до кінцевого акцептору. Ці речовини поділяють за принципом роботи або за місцем роботи в реакції.
- Аеробні дегідрогенази (оксидази) прискорюють перенесення електронів або протонів безпосередньо на кисневі атоми. Анаеробні ж роблять ті ж дії, але в реакціях, які протікають без передачі електронів або атомів водню на кисневі атоми.
- Первинні дегідрогенази каталізують процес відібрання атомів водню від окисляемого речовини (первинного субстрату). Вторинні - прискорюють зняття атомів водню із вторинного субстрату, отримані вони були за допомогою первинної дегідрогенази.
Інша особливість: будучи двукомпонентной каталізаторами з дуже обмеженим набором коферментів (активних груп), вони можуть прискорювати безліч найрізноманітніших реакцій окиснення-відновлення. Це досягається великим числом варіантів: один і той же кофермент може приєднатися до різних апофермент. У кожному випадку виходить особлива оксидоредуктаза зі своїми властивостями.
Існує ще одна функція ферментів цієї групи, про яку не можна не згадати - вони прискорюють протікання хімічних процесів, пов'язаних з виділенням енергії. Такі реакції називаються екзотермічними.
Трансферази - переносники
Ці ферменти виконують функцію прискорення реакцій перенесення молекулярних залишків і функціональних груп. Наприклад, фосфофруктокінази.
Виділяють вісім груп каталізаторів, виходячи з яку переносять групи. Розглянемо лише деякі з них.
- Фосфотрансферази - допомагають переносити залишки фосфорної кислоти. Вони діляться на підкласи відповідно до пункту призначення (спиртові, карбоксильні та інші).
- Амінотрансферази - прискорюють реакції переамінування амінокислот.
- Глікозілтрансферази - переносять глікозільниє залишки з молекул фосфорних ефірів до молекул моно- і полісахаридів. Забезпечують реакції розпаду і синтезу оліго- або полісахаридів в організмах рослин і тварин. Наприклад, вони беруть участь у реакції розпаду сахарози.
- Ацілтрансферази переносять залишки карбонових кислот на аміни, спирти і амінокислоти. Ацил-коензим-А є універсальним джерелом ацильних груп. Його можна розглядати як активну групу ацілтрансферази. Найчастіше переноситься ацил оцтової кислоти.
Гідролази - розщеплюють за участю води
У цій групі ферменти виконують функцію каталізаторів для реакцій розщеплення (рідше синтезу) органічних сполук, в яких бере участь вода. Речовини цієї групи містяться в клітинах і в травному соку. Молекули каталізаторів в ШКТ складаються з одного компонента.
Місцем локалізації цих ферментів є лізосоми. Вони виконують захисні функції ферментів у клітині: розщеплюють чужорідні речовини, що пройшли через мембрану. Вони також знищують ті речовини, які більше не потрібні клітці, за що лізосоми були прозвані санітарами.
Інше їх "прізвисько" - клітинні самогубці, так як вони є головним інструментом для аутолиза клітини. Якщо з'явилася інфекція, почалися запальні процеси, мембрана лізосом стає проникною і гідролази виходять в цитоплазму, руйнуючи все на своєму шляху і знищуючи клітку.
Поділяють кілька видів каталізаторів з цієї групи:
- естерази - відповідають за гідроліз складних ефірів спіртов;
- глікозідази - прискорюють гідроліз глікозидів, залежно від того, на якій ізомер вони діють, виділяють alpha-- або beta - глікозідази;
- пептид-гідролази - відповідальні за гідроліз пептидних зв'язків в білках, а за певних умов і за їх синтез, але цей спосіб синтезу білка не використовується в живій клетке;
- амидаз - відповідають за гідроліз амідів кислот, наприклад, уреаза каталізує розпад сечовини на аміак і воду.
Ізомерази - перетворення молекули
Ці речовини прискорюють зміни в межах однієї молекули. Вони можуть бути геометричні або структурні. Це може відбуватися різними способами:
- перенос атомів водорода;
- переміщення фосфатної групи;
- зміна розташування атомних угруповань в просторі;
- переміщення подвійного зв'язку.
функції ферментів в клітці
Ізомеризації можуть бути схильні органічні кислоти, вуглеводи або амінокислоти. Ізомерази можуть перетворювати альдегіди в кетони і, навпаки, цис-форму перебудувати в транс-форму і назад. Щоб краще зрозуміти, яку функцію виконують ферменти цієї групи, необхідно знати відмінності ізомерів.
Ліази рвуть зв'язку
Ці ферменти прискорюють негідролітіческім розпад органічних сполук по зв'язках:
- вуглець-вуглець
- фосфор-кисень;
- вуглець-сера;
- вуглець-азот;
- вуглець-кисень.
При цьому виділяються такі найпростіші продукти, як вуглекислий газ, вода, аміак, і замикаються подвійні зв'язки. Мало хто з цих реакцій можуть піти у зворотний бік, відповідні ферменти у відповідних для цього умовах каталізують процеси не тільки розпаду, а й синтезу.
Класифікація ліаз відбувається за типом зв'язку, яку вони розривають. Вони є складними ферментами.
Лігази зшивають
Головна функція ферментів цієї групи - прискорення реакцій синтезу. Їх особливість - спряженість створення з розпадом речовин, які здатні дати енергію для здійснення биосинтетического процесу. Існує шість підкласів за типом утвореною зв'язку. П'ять з них ідентичні підгрупах ліаз, а шоста відповідає за створення зв'язку "азот-метал".
Деякі лігази беруть участь в особливо важливих процесах клітини. Наприклад, ДНК-лігаза бере участь у реплікації дезоксирибонуклеїнової кислоти. Вона зшиває одноцепочечниє розриви, створюючи нові фосфодіефірні зв'язку. Саме вона з'єднує фрагменти Окадзакі.
Цей же фермент активно використовується в генній інженерії. Він дозволяє вченим зшивати молекули ДНК з необхідних їм шматочків, створюючи унікальні ланцюжки дезоксирибонуклеїнової кислоти. У них можна закласти будь-яку інформацію, створивши таким чином фабрику з виготовлення необхідних білків. Наприклад, можна вшити в ДНК бактерії шматочок, який відповідає за синтез інсуліну. І коли клітина транслюватиме власні білки, вона заодно наробить і корисна речовина, необхідне в медичних цілях. Його залишається тільки лише очистити, і воно допоможе безлічі хворих людей.
Величезна роль ферментів в організмі
Вони можуть збільшити швидкість реакції більш ніж у десять разів. Це просто необхідно для нормальної життєдіяльності клітини. А ферменти беруть участь у кожній реакції. Тому функції ферментів в організмі різноманітні, як і всі що протікають процеси. А порушення роботи цих каталізаторів призводить до тяжких наслідків.
Широко застосовуються ферменти в харчовій, легкій промисловості, медицині: використовуються для виготовлення сирів, ковбас, консервів, входять до складу пральних порошків. Також їх використовують у виготовленні фотоматеріалів.